根据《中共文山市委、文山市人民政府关于印发〈文山市机构改革实施方案〉的通知》精神，文山市农业农村局是文山市人民政府工作部门，为正科级；加挂文山市乡村振兴局、文山市畜牧兽医局牌子。内设办公室、农办秘书股、政策法规股、发展规划与高原特色产业股、种植业和农村合作经济指导股、养殖业股、乡村建设促进与农产品质量安全监管股、综合帮扶股、保障后扶与区域协作股、督察考评股、科学技术股11个机构和局直属机关党委。